醫用凈化工程，不僅指醫療機構內的凈化空間，如潔凈手術部、ICU，還包括醫療機構內部整體污染控制工程，如整體氣流組織、整體布局等。醫用凈化工程能夠為病人和醫護人員創造良好的醫療環境，提高醫療救治水平，因此得到醫療機構的廣泛認可。但是隨著醫用凈化工程的不斷新建及運行，一些問題已經開始引起醫療機構的關注。

　　首先是醫用凈化工程設備選型及工程造價問題。由于我國潔凈室設備生產企業和醫療機構的交流渠道不夠順暢，因此醫療機構在新建凈化工程時很難做到貨比三家，只能提出技術要求委托工程公司采購，這樣就很難控制設備選擇達到最佳的性價比，而這點也直接使得醫用凈化工程造價偏高，致使后期醫療成本走高。

　　其次是后期維護費用過高。據了解，目前很多醫用凈化工程的維護還是委托工程公司負責，無論是簡單維修、設備更新還是故障處理，都只能依賴工程公司，一方面造成故障響應速度緩慢，另一方面也使得維護費用過高。

　　最后是專業人才的匱乏。在工程公司完成交鑰匙工程后，醫療機構沒有渠道獲得專業的足夠人才來運行、管理、維護凈化工程，使得一些簡單的小問題都會影響工程的正常運行，降低了投資效益。

　　最近，針對以上問題，專家給出了相應的措施，并且部分醫療機構已開始逐步嘗試，培養醫療機構自己的技術力量，本著“設計、采購、施工”三獨立的原則建設凈化工程。相信不久后，醫用凈化車間工程與醫療機構勢必會達成新的合作模式。