手術室凈化工程中，應考慮到使用時的合理、方便、習慣、安全，爭取做到完美設計，還要考慮今后運行費用的節約問題及今后的升級換代問題和按需調整問題。

　　手術室凈化工程需站在建設方的角度上進行設計。首先要認真做好圖紙會審和技術交底，施工中會出現各種矛盾，這需要施工方，設計方和醫院方進行溝通合作，在保證手術室凈化工程施工質量的前提下進行合理變更。其次要嚴格控制材料設備的質量，對裝飾材料應嚴格按國家有關工程技術標準的要求進行檢驗和驗證。

　　正負壓切換手術室凈化工程設計在離電梯口的最近處、有專用的緩沖前室和緩沖走廊，采取相對應的隔離措施，可稱為一個獨立體，與正常使用的凈化手術室互不干擾。

　　凈化空調系統的調試工作是手術室凈化工程驗收階段不可少的一項重要工作。通過調試可以及時發現施工中存在的一些缺陷并及時進行整改和修補，調試對設計圖紙也是一個重要的驗證過程。

　　手術室凈化工程施工涉及裝飾、暖通、電氣和醫用氣體等專業，施工人員須對施工規范、施工工藝、施工質量有全面認識，要選擇專業正規的手術室凈化工程公司，否則，施工質量很難得到保障。

　　凈化領域廣泛，有電子、光學、醫療、食品等，其中又可大致分為生物潔凈室與工業潔凈室，建設時的重點不同，凈化手術室屬于生物潔凈室，因此，選擇的凈化工程公司應有建設生物潔凈室的水平，最好有手術室凈化的經驗。